University of Waikato chính thức thành lập vào năm 1964, tọa lạc trên một khuôn viên rộng 65 mẫu tại Hamilton, New Zealand. Vào năm 1989 (với sự trợ giúp từ NASA), University of Waikato đã kết nối New Zealand với Internet trước khi trở thành trường đại học đầu tiên ở New Zealand có sinh viên tốt nghiệp trực tuyến, hoàn thành bằng cấp giảng dạy qua Internet.

Hiện nay có khoảng 12,000 sinh viên đang theo học tại trường đến từ nhiều quốc gia trên thế giới. Ngoài ra, trường còn sở hữu một điểm trường lẻ tại Tauranga với lứa sinh viên tốt nghiệp tại đây là vào năm 2001.